Die Kombination von Gehölzen mit ihrer Unternutzung in Agroforstsystemen und ihre Einbettung in eine sozioökonomische Umwelt führt dazu, dass Agroforstsystem-Forschung per se interdisziplinär - und unter Einbindung von Praxisbetrieben – auch transdisziplinär ist. Die ökologischen Synergien zwischen den biotischen und abiotischen Systemkomponenten sind maßgeblich für die Vorteile von AFS verantwortlich. Daher ist Grundlagenforschung zum Verständnis dieser Effekte in verschiedenen silvoarablen und silvopastoralen AFS erforderlich, um anwendbare, an die Gegebenheiten von Betrieb und Umwelt angepasste Systemkonfigurationen in Praxisforschungsprojekten zu entwickeln und zu testen.